تفاوت ولایت فقیه با ولایت طاغوت خاصیت طاغوت این است؛ «وَ إِذا تَوَلَّى سَعى فِی الْأَرْضِ لِیُفْسِدَ فیها وَ یُهْلِکَ الْحَرْثَ وَ النَّسْلَ وَ اللَّهُ لا یُحِبُّ الْفَسادَ»(بقره/۲۰۵) وقتی ولایت را به دست گرفت، تلاش میکند که در زمین فساد ایجاد کند.